高性能計算已成為(wei) 支撐科學研究和技術創新發展的基本方法，也將成為(wei) 高等院校提升科技創新能力的重要手段。超級計算將在高校農(nong) 業(ye) 科學、生命科學、環境科學、食品質量和安全、生物信息、流體(ti) 力學、計算化學、高能物理、信息技術、仿真計算等科學研究領域發揮重要的作用。高性能計算平台可為(wei) 科學研究提供大規模高性能科學計算和仿真計算服務，為(wei) 高層次人才培養(yang) 、學科建設提供多學科交叉融合的平台及環境，是高校提高人才培養(yang) 質量、提升科研水平和學科競爭(zheng) 力的必然需求。
1 高性能計算平台建設背景
2 我校高性能計算平台建設概況
3 我校高性能計算平台應用實踐
4 問題與(yu) 思考
第一，高性能計算平台建設需要結合應用需求，不能盲目追求計算機峰值。針對農(nong) 業(ye) 院校各學科不同應用的計算特點，在高性能計算平台建設過程中，要統籌考慮軟件和硬件建設，根據迫切程度購置相關(guan) 硬件設備，比如農(nong) 學類、測繪類等專(zhuan) 業(ye) ，部分用戶有高存儲(chu) 服務器的需求，需要較大的存儲(chu) 空間。因此，針對用戶需求、依據農(nong) 業(ye) 院校專(zhuan) 業(ye) 與(yu) 學科特點去擴充資源，才能最大化地節省資源，最大限度地發揮其作用。
第二，在高性能計算平台運行過程中，需要加強管理，合理調度作業(ye) 進程，提高利用率。有針對性地對操作係統多核版本、多級並行編程模型、編譯器和應用軟件等進行進一步的研究，提高應用軟件在多核大規模計算機係統上的運行效率，開發易於(yu) 使用的高性能計算機係統，降低高性能計算平台的使用門檻。
第三，高性能計算平台涉及模型建立、並行算法、應用測試等多個(ge) 領域，具有綜合性、係統性等特點，因此，急需加強對既懂專(zhuan) 業(ye) 知識又懂計算科學的複合型人才的培養(yang) ，還需加強不同學科之間的交流與(yu) 合作。
第四，建立農(nong) 業(ye) 高校信息化建設一盤棋的思想，建設各學科、各領域的應用網格係統，實現高性能計算平台的資源整合與(yu) 共享，提高資源利用效率，才能為(wei) 學校更多的用戶提供高質量的高性能計算應用服務[13]。
參考文獻
[1] DONGARRA J J, MEUER H W, STROHMAIER E. TOP 500 Supercomputer Sites Sites, 11th Edition[M]. University of Tennessee, 1998.
[2] 黨(dang) 崗,程誌全.超級計算中心核心應用的淺析[J].計算機科學,2013,40(3):133-135.
[3] 趙立成,沈文海,肖華東(dong) ,等.高性能計算技術在氣象領域的應用[J].應用氣象學報,2016,27(5):550-558.
[4] 唐衝(chong) ,徐炯,葉姣雲(yun) .高校信息化建設中“信息孤島”的成因和對策研究[J].浙江中醫藥大學學報,2013(5):631-632.
[5] 劉培,何彤宇.基於(yu) 雲(yun) 計算的高校管理信息係統構建研究[J].軟件導刊,2015(5):119-120.
[6] 張雲(yun) 泉.2018年中國高性能計算機發展現狀分析與(yu) 展望[J].計算機科學,2019,46(1):1-5.
[7] 鐵兵,劉曉玲,陳雲(yun) 海.大數據環境下超算中心的服務及定價(jia) 分析[J].電信技術,2014,1(10):11-14.
[8] 陳新宇,劉倩,張寶花,等.基於(yu) 高性能計算環境的科學計算應用平台設計與(yu) 實現[J].科研信息化技術與(yu) 應用,2016(5):43-51.
[9] YU J . PGAP: pan-genomes analysis pipeline[J]. Bioinformatics, 2012, 28(3):416-8.
[10] 莊尚德,周泓伶,李睿.信息化機房安全監控與(yu) 維護管理[J].中國水運:航道科技,2016(3)51-56.
[11] 周宇.超級計算機監控係統關(guan) 鍵技術研究[D].長沙:國防科技大學,2016.
[12] 孫曉勇.高通量測序技術在選擇性剪接研究中的應用[M].北京:中國農(nong) 業(ye) 出版社,2018.
[13] 趙毅,朱鵬,遲學斌,等.淺析高性能計算應用的需求與(yu) 發展[J].計算機研究與(yu) 發展,2007,44(10):1640-1646.
董曉亮 宋長青 李俊清 周 虎 王秀美 山東(dong) 農(nong) 業(ye) 大學農(nong) 業(ye) 大數據研究中心 |
